При неверном указании в счете-фактуре ставки НДС (следовательно, и стоимости товара) необходимо выставить исправленный счет-фактуру.

Обоснуем ответ.

Корректировочный счет-фактура выставляется при изменении стоимости или количества отгруженных товаров при наличии первичного или иного документа, подтверждающего согласие покупателя на изменение стоимости (в т. ч. количества) отгруженных товаров (п. 3 ст. 168, п. 10 ст. 172 НК РФ). Без таких документов выставляется исправленный счет-фактура.

Поскольку в рассматриваемой ситуации в счете-фактуре допущена ошибка (неверно указана ставка НДС и, как следствие, стоимость товара), необходимо выставить исправленный счет-фактуру. Исправления вносятся путем выставления нового экземпляра счета-фактуры с тем же номером и датой (п. 7 Правил заполнения счета-фактуры, утв. постановлением Правительства России от 26.12.2011 № 1137). Для этого в форме счета-фактуры предусмотрена дополнительная строка 1а "Исправление № __ от __". В этой строке продавец указывает номер и дату исправления. В исправленный счет-фактуру переносятся все корректные данные из первичного счета-фактуры, а вместо неправильных данных заносятся правильные.

Исправленный счет-фактура должен быть выставлен по форме, которая действовала в период оформления первоначального счета-фактуры (письма Минфина России от 06.05.2019 № 03-07-11/32905, ФНС России от 07.06.2018 № СД-3-3/3806@).

После составления исправленного счета-фактуры необходимо внести исправления в книгу продаж. Ошибки, обнаруженные после окончания квартала, исправляются в дополнительном листе к книге продаж за период, в котором у налогоплательщика появилась обязанность по уплате НДС (в момент определения налоговой базы), причем независимо от того, когда выставлен исправленный счет-фактура (п. 3, 11 Правил ведения книги продаж, утв. постановлением Правительства России от 26.12.2011 № 1137). В рассматриваемом случае внести исправления следует в книгу продаж за II квартал. Для этого в дополнительном листе книги продаж аннулируется запись о счете-фактуре (повторить запись с отрицательными числовыми значениями) и регистрируется исправленный счет-фактура (п. 11 Правил ведения книги продаж, п. 3 Правил заполнения дополнительного листа книги продаж, утв. постановлением Правительства России от 26.12.2011 № 1137).

При регистрации исправленного счета-фактуры заполняются те же графы книги продаж, что и при регистрации первичного счета-фактуры, а также заполняется графа 4 книги продаж "Номер и дата исправления счета-фактуры".

После этого необходимо подать в ИФНС уточненную декларацию по НДС за II квартал, при необходимости предварительно уплатив недоимку и соответствующие пени.